با توجه به توسعه روزافزون جمعیت و ضرورت دسترسی به منابع آب سالم ودفع بهداشتی فاضلاب و استفاده مجدد از پساب، علوم مرتبط با آب و فاضلاب گسترش زیادی یافته است. دانشگاه‌های ایران گام‌های بلندی در توسعه کمی و کیفی این دانش در بخش‌های آموزش و پژوهش و توسعه فناوری برداشته‌اند. از طرف دیگر نیازهای عملی این بخش از سوی شرکتهای آب و فاضلاب تامین می‌شود که بدلیل کمبودهای مالی و تکنولوژیک دچار کاستی‌هایی می‌باشد. به همین دلیل وجود یک انجمن علمی که بتواند ارتباط ارگانیک و منطقی بین توسعه این علم در دانشگاه‌ها و نیازهای عملی این بخش را برقرار کند بسیار ضروری بود.
در این راستا جمعی از دانشمندان و صاحب‌نظران این بخش که ظرف 15 سال گذشته در قالب هیئت تحریریه نشریه آب و فاضلاب از نزدیک با یکدیگر و با موارد علمی و عملی مربوطه آشنا شده بودند تصمیم گرفتند با تشکیل انجمن آب و فاضلاب ایران این خلاء را جبران نمایند. مجوز تاسیس این انجمن در تاریخ 1393/11/01 از سوی کمیسیون انجمن‌های علمی وزارت علوم، تحقیقات و فناوری صادر گردید.